Ανέκδοτες πηγές της κρητικής εκκλησιαστικής ιστορίας των χρόνων της οθωμανικής κυριαρχίας δημοσιεύονται σε συνέχειες στα Κρητικά Χρονικά. Πρόκειται για έγγραφα που απέστειλε το Οικουμενικό Πατριαρχείο προς την εκκλησία της Κρήτης, η εκκλησία της Κρήτης προς το Πατριαρχείο, η μητρόπολη προς τις επισκοπές του νησιού και προς τους Χριστιανούς κ.ά. Αποτελούν πολύτιμους μάρτυρες της εκκλησιαστικής οργάνωσης του νησιού και των σχέσεων του με την Κωνσταντινούπολη και με τις οθωμανικές αρχές. Κάθε έγγραφο συνοδεύεται από λεπτομερή σχολιασμό. Το πρώτο αυτό μέρος της έκδοσης περιλαμβάνει πατριαρχικά έγγραφα της περιόδου από το 1742 έως το 1781.